该病是由一种镰刀菌的真菌为害所致，是危害辣椒生产的主要病害之一。植株发病初期，白天萎蔫，早晚恢复，反复一周后，整个植株萎蔫枯死，病株根皮变为呈锈腐状，极易脱落，剖开病部，可见维管束变褐，湿度大时，其上略带有粉红色病原物。
二、发病特点
仅为害辣椒的根，根茎部和地表以下的茎基部，感病部位的维管束变褐。由于该病不向上发展，因而地上部茎干的维管束不变色。辣椒根腐病是一种土传病害，病原菌常年生存在茄果类和瓜类蔬菜的温室大棚土壤中。辣椒定植后，如出现低温、高湿，或幼苗根部出现伤口，病菌就会乘机通过根毛气孔和伤口侵入而引发根腐病，并借助灌水进行传播扩散。
三、防治方法：
1、高温闷棚杀菌：当辣椒拉秧后，在7-8月份进行高温闷棚。方法是将切碎的麦草和50公斤生石灰均匀撒在地里，铺上废旧地膜后灌水闷棚15-20天，可使棚内5-10厘米土层温度达到40℃以上，可有效杀灭土中的多种病原菌。
2、管好育苗床：移栽定植时选用无病健苗。
3、移栽时，定植穴内施药土。药土的配制是400克多菌灵与100公斤细沙混匀，每穴放上5克左右即可。
4、合理灌水：辣椒生长期控制浇水量，既防止干旱引起根系受伤，又可防止大水漫灌而引起沤根。
5、如棚内发现病株，及早进行药剂防治。可选用50%多菌灵或50%甲基托布津500倍液，20%甲基立枯磷1200倍液或50%DT可湿性粉剂400倍液进行灌根。注意一定要让药液流入土内，湿润茎基部土壤，10天1次，2-3次即能收到较好的防效。
