燕麦田常见的病害种类有坚黑穗病、锈病、红叶病，虫害有金针虫、蛴螬、蝼蛄、蚜虫、粘虫、土蝗等。
病虫害的防治坚持“预防为主，综合防治”的植保方针，根据有害生物综合防治的基本原则，采用抗（耐）病品种为主。以栽培防治为重点，物理、化学防治有机结合的综合防治措施。
1、农业防治:实行3年以上的轮作制度，以控制坚黑穗病、野燕麦杂草的发生；选用抗病品种；加强田间管理，适时追肥浇水，中耕，培育壮苗，增强植株抗病虫能力；燕麦收获后及时清除病株残体，清除田问杂草，耕翻灭茬，拔除田间野生燕麦杂草，消灭越夏病源和虫源。
2、 药剂防治
蚜虫防治:孕穗抽穗期百株蚜量达500头以上时，每亩用50%抗蚜威可湿性粉剂4—8克，对水40～50公斤均匀喷雾，残留期7天，可灭蚜虫。
粘虫防治:用90% 的敌百虫1200倍液，或50%敌敌畏2000倍液喷雾，每亩喷50公斤药液。
杂草防治:每亩用25%的绿麦隆0.4～0.5公斤，对水25公斤，也可用40%的野麦果0.2公斤，对水25公斤，或对细土20公斤，于播前或播后喷撒地面，然后耙地，对野燕麦的防治效果达96%以上。
