随着人民生活水平的不断提高，绿色无公害食品的生产深受关注，无公害水稻生产也是如此，但稻瘟病的防治多年来始终困扰着广大种植户们，通过农户多年种植摸索得出经验，无公害水稻生产过程中，防治稻瘟病应该遵循的原则是要以种植抗病品种为基础，减少菌源为前提，加强保健栽培为关键，药剂防治为辅助的综合防治措施。
1、因地制宜，种植抗病品种。注意定期轮换品种、合理布局和不大面积种植同一品种。
2、减少菌源。做到不用带菌种子，及时处理病稻草并对种子进行消毒。
3、改进栽培方式，加强肥水管理。生育期相当的抗病品种和感病品种混作；不偏施和过多施用氮肥，注意氮，磷，钾配合，适当使用含硅酸的肥料。浅水栽秧、寸水活棵、薄水促蘖、打苞深水、干湿壮籽的灌溉方式。
4、药剂防治。苗瘟一般在秧苗3~4叶期或移栽前5天施药；穗颈瘟在破口至始穗期开始施药，以后视天气情况在齐穗期施第二次药，常用药剂有三环唑、稻瘟灵（富士一号）等。
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