菌糠是指栽培各种菌类以后剩下的废料。实践表明：每100kg培养料，收获100kg鲜菇后，还可以得到60kg废料。这些废料均含有大量菌丝体、蛋白质及其他营养物质，被称为“菌糠蛋白”。经适当加工处理，可以作为饲料或添加剂，完全可以替代一部分饲料用粮及其他营养元素。
下面是几种菌糠的具体应用情况。
1平菇、凤尾菇菌糠饲料
1.1研究表明，利用棉籽壳栽
培凤尾菇，菌糠中的粗蛋白从种菇前的5.65%增加到7.9%，粗纤维从种菇前的51.45%减少到9.32%；脂肪略有增加；还原糠从2.1%增加到3.9%，总糠从19.8%增加到25.2%。以棉籽壳栽培平菇后，菌糠中粗蛋白比纯棉籽壳增加9.30%、无氮浸出物增加9.74%、钙增加159.26%，粗纤维含量则降低17.37%。以稻草栽培凤尾菇，每百千克干物质中，17.56%-26%转化为子实体，18.91%-42.27%变为热能消耗，则还有40.17%-55.08%约近一半左右留在料中。分析平菇、凤尾菇菌糠中的营养状况，为综合利用这些资源提供了理论依据。
1.2据有关报道，在每千克含消化能2.762KJ，粗蛋白14.78%，可消化粗蛋白113g的生长肉猪配合饲料中，以45%的平菇菌糠代替等量麸皮，进行比较饲养，菌糠组平均增60.4g，日增重504g，分别比麸皮组提高13.96%和14.03%。
1.3用菌糠养猪，每增重1kg，养猪成本下降35%；菌糠饲料喂猪，平均每头猪可节约粮食75kg左右，节约成本50元。凡投料2000kg的食用菌专业户，可得菌糠约650kg，可供养3头肥猪，仅此一项可增产值1200多元。
2金针菇菌糠饲料
用棉籽壳栽培金针菇后，其菌糠能满足生猪生长发育需要，很适合饲养瘦肉型生猪，使生猪增重率达30%-70%，且肉质好。
3香菇菌糠饲料
香菇菌糠含粗蛋白8.76%、粗脂肪0.62%、粗纤维30.0%、灰分7.93%。每千克菌糠中含钙0.86g、磷3.6g、钾4.04g、钠8.7g、铜0.0049g、镁1.58g、铁0.69g、锌0.06g、锰0.0774g。对菌糠进行科学地配方，可喂养猪、鸡、鸭、鹅，使鸡、鸭等家禽，产蛋率提高10%-15%。
3.1香菇菌糠的制作方法将采收完香菇的菌筒，进行认真挑选，除去感染杂菌、沾附污泥、被白蚁侵食及养料严重消耗的菌袋，对转色不好，菌筒上菌皮过厚的应用刀刮去表层再用。对挑选出来的菌筒，用人工或粉碎机进行粉碎，经晒干后密封备用。
3.2利用香菇菌糠喂猪其喂养量要逐步调整，由少到多，使猪有一个适应的过程。在开始的10-15d，菌糠的用量在日粮中比例占5%-8%，以后逐渐增加，最高饲料以下不超过20%为宜。也可以视饲喂对象而有所不同；20kg以下的仔猪，菌糠用量为8%-12%；30kg以上架子猪，加入量为15%-20%。
3.3香菇菌糠喂长毛兔以甘蔗渣78%、米糠20%、糠1%和石膏1%为培养料栽培香菇后，把菌糠晒干、打碎，喂养断奶的幼兔，以等量麸皮作对照，喂菌糖饲料组毛长增加，体重增加，可代替作部分精料、作添加剂使用。
4香菇菌皮饲料
香菇菌皮含蛋白质12.62%、粗纤维18.3%、磷0.23%、钙0.57%、总氨基酸9.25%、必需氨基酸4.43%。较一般常规饲料营养丰富。试验表明，用香菇菌皮作饲料添加剂，对提高猪的瘦肉率有很好作用。
5蘑菇菌糠饲料
经测定蘑菇菌糠含粗蛋白10.92%，精蛋白9.93%，粗脂肪14%、精纤维3.25%，其余各种营养成分均超过谷物统糠。蘑菇菌糠的处理及喂猪方法：除去菌糠中的杂菌和土粒，渗入65%的青饲料、0.5%食盐水加水拌匀直接喂养生猪；也可以将菌糠及时下床，去掉土层和杂菌，于干燥处按一层菌糠，撒一层0.5%食盐堆积并加盖薄膜，临喂时，取出菌糠与青饲料拌合即可投入喂养；还可以将菌糠晒干、粉碎加拌青饲料和食盐稀释喂猪。饲喂时，先进行猪的适口性训练，待习惯后，逐渐增加菌糠用量。夏季用菌糠喂猪，能加快育肥，缩短存栏期，提高养猪的经济效益。
6滑菇菌糠
以木屑和米糠为主料栽种滑菇、金针菇后，所得菌糠量分别是其各自产菇量6倍和5倍。用菌糠作鸡饲料添剂时，用于蛋用鸡时的添加量约为新鲜菌糠的2%-3%；用于肉用鸡饲喂时，约用5%-10%的新鲜菌糠。收集菌糠可以用青贮或风干贮存，现配现饲喂，约在2-3d将一批料用完。
7菌糠饲料
繁殖蚯蚓取磨菇、平菇和凤尾等菌糠，打碎，浇水浸湿，堆积发酵，使种姑及加入的农药和肥料得到充分分散，发酵5-7d后，翻一次堆，直到充分发酵，后补足水分65%-70%，将pH值调节到6-9，将培养料装入木箱或养殖池内，培养料厚度不宜超过20cm，按培养料体积接种一定数量的蚯蚓。将木箱置于阴凉处，保温20-28℃培养。以凤尾菇菌糠饲养蚯蚓，经2个月。可增殖50倍。蚯蚓经加工成蚯蚓粉，是质优、价廉的高蛋白饲料。
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