1、不要出池后立即施用。一般应先在储粪池中存放5-7天后再施用；沼渣与磷肥要按照10:1的比例堆沤5-7天后再用效果更好。
2、不要不兑水就直接追施。，尤其是用来追施幼苗，会使作物出现灼伤现象象。所以沼肥作追肥时，要先兑水，一般兑水量为沼液的一半。
3、不要在表土上浇施。一是降低肥效，二是造成温室短时期内有害气体浓度过大，应采用穴施和沟施的方法，施后盖土。施用于水田时，应犁耙并均匀地撒施在田面上，然后用犁翻到底层。
4、不要过量施用沼肥。用沼肥的量不能太多，一般要比施用普通猪粪肥少。若盲目大量施用，会导致作物徒长，行间阴蔽，造成减产，甚至会造成肥害。
5、不要与草木灰、石灰等碱性肥料混施，否则易造成氮肥的损失，降低肥效。
