一是要注意秸秆翻压深度。深翻在玉米秸秆粉碎撒入田间后，不论该田是复种小麦还是歇茬，都要立即深翻 25厘米 以上，将秸秆全部覆盖严实，并用旋耕机平整土地。坚决不能使撒在地面上的秸秆长时间裸露地面，经风吹日晒，失水过多，降低还田效果。
二是注意秸秆翻埋量玉米秸秆还田时翻埋量不宜过多，一般每亩500-700千克 为宜。还田量过多，不仅会影响秸秆腐烂、分解的速度，而且在秸秆腐烂、分解过程中产生的各种有机酸过多，对下料作物的根系还有损害作用。
三是注意粉细，秸秆还田在粉碎秸秆时要用大型秸秆粉碎机，使秸秆粉碎的长度在 5厘米 左右，以免秸秆过长土压不实，影响作物的出苗与生长。
四是注意要及时灌水，玉米秸杆还田后要根据土壤墒情，及时灌水，促进秸秆腐烂速度，防止秸秆在腐烂过程中与小麦争水的矛盾。凡留作第二年春播的田块，也要根据气候情况，在土壤水分不足时要提早灌水，促进秸秆腐烂。旱地要在玉米秸秆还田后，及时做好保墒工作，最好在深翻后带耱或镇压，保蓄水分，以利于秸秆吸水分解。
五是注意应补施养分补施养分，是为了解决微生物与幼苗争夺养分的矛盾。微生物为了分解有机物质，必然会与作物幼苗争夺土壤中的速效养分，影响幼苗的正常生长，因此要施足底氮肥，以防土壤微生物分解秸秆时与幼苗争养分造成黄苗。在翻压前每亩需要补施尿素10千克或碳铵25-30千克，过磷酸钙15-20千克 ，复种田块要适当增加肥料的施用量，促进秸秆腐烂速度，防止秸秆腐烂、分解与小麦争肥的问题。
六是杜绝让带病的秸秆还田，这类秸秆应销毁或高温堆腐后再使用。
