当沼气池启动使用一段时间后，又没有足够量的畜禽粪便或根本没有畜禽粪便时，可以用经过简单堆沤处理的新鲜农业废弃有机物为沼气池主要发酵原料。这时，必须在沼气池进料口旁建设一个约0.5m3的原料预处理池，预处理池池墙底部设排料口与沼气池进料口连接，并在连接处安装闸阀（或开关），预处理池底部要略高于进料口上缘。原料收集后倒入预处理池，并从沼气池水压间抽取沼液加入预处理池，使原料保持湿润堆沤。3-7天后待原料基本腐烂后，再加入沼液进行搅拌，并用PH试纸（或酸碱度检测仪）检测酸碱度，发酵液的酸碱度以6.5～7.5为佳，偏酸时需进行调节。确定酸碱度适宜后打开开关使搅拌后的混浊液经进料口流入沼气池，剩下的粗残渣与新鲜原料继续堆沤。
新鲜农业废弃有机物主要有蔬菜采摘的下脚料、花生藤、薯藤、果园废弃的无食用价值劣质果（梨、柑桔等）及蔬果汁加工残渣等农副产品加工的下脚料。由于他们的组织鲜嫩，易于被微生物分解利用。注意最好不用木薯初加工后的残渣或青烟叶，这两种原料一旦投入过多容易造成池子停止产气，一定要时只能少量添加，并搭配畜禽粪便。
