1、补充投料：为保证沼气微生物有充足的营养，能正常而持久的产气，应每天进料或每隔数天进料一次。通常保持发酵液浓度8%左右，8立方米沼气池每天需进猪粪24公斤，相当于两头中等大小猪的日排泄量。如采用定期加料，应尽量将所需添加的原料分作几次加入，这样池内的各工艺条件变化小，恢复正常的时间短、效果好。进出料的原则是坚持先出后进，出多少，进多少。出料时液面高度不能低于出料管的上沿。出料后若没有足够的原料入池，可补充加入相应数量的水，使液面达到所要求的高度为止。但平常进出料不宜太多，否则会影响发酵液浓度和产气效果。如果启动时投料较多，可在启动运行1个月后开始补充投料。
2、日常搅拌：每隔5-7天搅拌一次。用多功能出料器搅拌能使发酵原料与沼气微生物充分接触、有利于提高产气率，并可破坏浮渣结壳层，提高发酵原料的分解利用率。无此装置的，可采用取出水压间料液，又从进料口冲入，每次3-5担。注意在冬天搅拌应选择晴天进行，以避免热量的损耗。
3、适时出料：发酵原料在沼气池内要停留一段时间才能得到较充分的分解利用。人畜粪便的停留时间一般需要40-80天，作物秸秆需要120天以上。尽管经过长时间的发酵，仍有一些难以分解的物质会转变成沼渣残留在池内。沼渣会使沼气池有效容积减少，产气效率下降。因此，要定期抽渣出池。大出料前20-30天，应停止进料，以免浪费发酵原料。大出料时，可留下20-30%的池底沼渣作接种物。注意操作安全，防止发生窒息事故。
4、冬季保温：沼气池发酵温度会随季节变化而变化，冬天池温低，产气量会下降。在冬季来临之前应做好沼气池的保温工作，可在沼气池上覆盖稻草、塑料地膜等。
5、及时处理异常情况：发现产气异常或不产气，应及时查找原因。可能原因主要有：原料不足、农药中毒、酸化、漏气等。
