甘薯除了食用和加工淀粉外，都要贮藏一部份作为次年食用和种子来源。在这贮藏期间，甘薯易受甘薯黑斑病和甘薯软腐病的侵害，每年都有不同程度的损失，轻则5%～10%，重则30%以上。把好甘薯贮藏期的各个技术环节关，以减少甘薯贮藏期病害的损失。
1适时收获。当前已是寒露时节，明溪甘薯已陆续收获，作为种源，应选择在晴天收获，收获后在太阳光下晒上3～4小时，有利于杀死甘薯表面的黑根霉菌，达到一定的防效作用。
2精细选种。贮藏前要精细选种，把一些病薯，伤薯剔除，以减少菌源和病菌从伤口侵入；
3薯窖消毒。用硫磺熏蒸(每立方米用硫磺15g)24小时，然后充分通风；
4种薯消毒。入窖前用50%甲基托布津可湿性粉剂500～700倍液，或用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液，浸蘸薯块1～2次，晾干入窖。
5保温防冻。窖内温度保持在10～14℃，相对湿度85％～90％最适宜。低于10℃，易受冻害。相对湿度高于90％，温度15～25℃，易发生甘薯软腐病；温度23～27℃，易发生甘薯黑斑病。
6贮藏期勤检查。在贮藏期，每15～20天应打开窖门换气，排除CO2等有害气体，待窖内薯堆温度降至12～14℃时把窖门关上。每年12月至翌年1月，明溪常有大霜大雪，最低气温可降至-6℃，易受冻害，应注意保温防冻；在3月明溪气温回暖，雨水增多，应及时放风，排除湿气，同时勤检查，发现病薯，及时剔除。
