在实际中，减蛋综合征灭活油乳剂苗、大肠杆菌灭活油乳剂苗、新城疫－传支二联灭活油乳剂苗等的防制效果均优于进口苗。所以选择疫苗时应以具体生产实践结果为标准，避免引进新毒株疫苗，造成免疫效果较差而又造成新毒株的污染。
另外，还要注意疫苗是弱毒还是中毒疫苗。如新城疫疫苗在首免时一般选用弱毒苗，在青年鸡免疫时选用中毒疫苗进行加强免疫，否则会引起明显的临床反应。在实际生产中笔者选用clone30和Ⅳ系新城疫疫苗进行首免，二免、三免时选用Ⅳ系或Lasota系疫苗，在蛋鸡发生非典型新城疫时选用I系苗进行紧急接种；在传染性法氏囊病首免时选用弱毒疫苗如传染性法氏囊B87疫苗或法氏囊三价疫苗（哈尔滨兽医研究所）、传染性法氏囊2号或3号弱毒疫苗（富道公司生产），二免时选用中毒疫苗。如果首免选用中毒苗会造成法氏囊的损伤，不仅会影响法氏囊本身的免疫效果，还会影响其他疫苗的免疫效果。
所以从一定程度上讲，国产疫苗的种毒选自国内的病料，有较强的针对性。只要在应用时能正确选择针对本地区毒株的疫苗，就能取得良好的防治效果。
