随着中国加入WTO和消费者安全意识的提高，药物残留将是影响畜牧业发展和农民养殖增收的重要障碍。减少药物残留、生产绿色畜禽必须注意正确使用兽药。
1、严格禁止使用某些兽药。目前，国家已制定了兽药禁用清单，畜禽饲养者应严格遵守。要按规定决不使用盐酸克伦特罗等β－兴奋剂类、已烯雌酚等性激素类、玉米赤霉醇等具有雌激素样作用的物质、氯霉素及其制剂、呋喃唑酮等硝基呋喃类、安眠酮等催眠镇静类等21类药物。如果生产的畜禽产品是用于出口，禁用兽药的范围更大，比如欧洲允许使用的抗生素只有莫能霉素、盐霉素、黄霉素和卑霉素等四种。
2、有条件地使用某些兽药。有些药物虽然允许使用，但其在畜禽体内吸收、分布、转化和消除有一个过程，必须停止用药一段时间后，产品才能用于食用。例如使用伊维菌素驱虫，休药期至少应达到牛28天，羊8天，猪5天后才能上市屠宰。在屠宰前休药的同时，有些药物在动物的某一生长阶段不可使用，如洛克沙胂：休药期5天，蛋鸡产蛋期禁用; 莫能菌素钠（欲可胖，瘤胃素）：休药期5天，蛋鸡产蛋期及奶牛泌乳期禁用; 马杜霉素（加福，抗球王）：休药期5天，蛋鸡产蛋期禁用; 尼卡巴嗪和乙氧酰胺苯甲酯（球净）：休药期9天，蛋鸡产蛋期禁用等。
3、尽量使用兽药替代物。在预防和治疗畜禽疾病及促进畜禽生长时，应尽量使用绿色物质替代会产生药残的药物。一是使用中医药，对畜禽产品及环境没有污染，某些植物还具有促生长作用; 二是使用益生素，可竞争性排斥病原菌，具有提高饲料转化效率、促进畜禽机体免疫功能、降低死亡率及改善环境等效果; 三是使用酶制剂，可提高饲料转化效率，减少环境污染; 四使用生物活性肽，可提高动物免疫力，促进动物生长。此外，糖萜素对沙门氏菌等多种致病菌、柔嫩艾美耳球虫和传染性法氏囊炎均有良好的抑制作用，酸化剂可促进畜禽生长，防治仔猪腹泻，有机微量元素具有提高畜禽生产性能、机体免疫功能和其它养分利用率等作用。
4、其它应注意的问题。畜禽养殖者应注意科学饲养，加强管理，减少畜禽发病，力争少用药物。必要时，经确诊后再对症下药，注意药物与饲料药物添加剂之间的协同和药物之间的协同，避免重复用药。改变某些终身用药的方法为阶段性适时用药。坚决禁止将抗生素作为饲料添加剂和将在停药期内的病畜禽急宰出售。
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