在防治畜禽传染病中，合理使用消毒药是很重要的，针对不同的消毒物体，应选择理想的消毒药物。理想的消毒药应是：杀菌性能好，作用迅速；对人畜和物品无损害；性质稳定，可溶于水，无易燃和爆炸性；价格低廉，容易得到。但是，现有的消毒药都存在一定的缺点，还没有一种消毒药是完全理想的，也就是说，还没有一个消毒药在任何条件下能够杀死所有的病原微生物。消毒药的作用受许多因素的是影响而增加或减弱，在实际工作中，为了充分发挥消毒药的效力，对这些因素应该是很好了解和应用：
1 微生物的敏感性 不同的病原微生物，对消毒药的敏感性有很明显的不同，例如病毒碱和甲醛很敏感，而对酚类的抵抗力却很大。大多数的消毒药对细菌有作用，但对细菌的芽胞和病毒作用很小，因此在消灭传染病时应考虑病原的特点，选用消毒药。
2 环境中有机物质的影响 当环境中存在大量的有机物如畜禽的粪、尿、血、炎性渗出物等时，能阻碍消毒药直接与病原微生物接触，而影响消毒药效力的发挥。另一方面，由于这些有机物，往往能中和和吸附部分药物，也使消毒作用减弱，因此在消毒的药物使用前，应进行充分的的机械性清扫，消除消毒物品表面的有机物，使消毒药能充分发挥作用。
3 消毒药的浓度 一般说来，消毒药的浓度愈高，杀菌力也就越强，但随着药物浓度的增高，对活组织的毒性也就相应地增加了。另一方面，当浓度达到一定程度后，消毒药的效力也就不再是增高。因此，在使用中应选择有效和安全的杀菌浓度，例如70%的酒精杀菌效果要比95%的酒精好。
4 消毒药的温度 消毒药的杀菌力与温度在正比，温度增高，杀菌力增强，因而夏消毒作用比冬季要强。
5 药物作用和时间 一般情况下，消毒药的效力与作用成正比，与病原微生物接触并作用的时越长，其消毒效果就越好。作用时间若太短，往往会达不到消毒的目的。
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