2、消灭病原体，包括细菌、病毒和寄生虫。其药物可选用如西药的喹诺酮类、多粘菌素类、氨基糖甙类等。但最终要以病原对药物的敏感程度而定。
3、调节肠道内环境。此原理为：抑制厌氧菌的生长，保护肠道有益菌，维持肠道的正常PH值。常用的药物有甲硝唑、或者替硝唑和一些中药。
4、修复受损的肠道粘膜，避免重复感染。常规用药是补充维生素A，这在治疗过程中也是很有必要的。因为VA可以维持粘膜上皮细胞的完整性、修复被损粘膜，从而防制腹泻的复发。
5、补充电解质和维生素。对于我们养殖户来说，有一点需要注意，那就是切不可有病乱投药，一定要标本兼治。就肠道病而言，它的症状为标——即腹泻，致病因素为本——即病原等。决不可只为止泻而忽略了对致病原的消除;只为抗菌而忽略了对肠道毒素的排除和粘膜的保护等等，这些都是不可取的。而只有采取积极预防的手段和标本兼治的原则，才可能最大的降低“肠道病”对我们养殖业的危害。
