当鱼饵料中部分地或完全缺乏钙、磷或维生素D等营养素，或由于鱼受鞭毛虫类感染而导致食物运行到肠内时，这些营养素被寄生虫所吸收。同时由于大量的鞭毛虫类的感染而减弱寄主肠内粘膜的吸收能力，从而导致营养缺乏症－－穿孔病。
当鱼体内缺乏钙、磷和维生素D等必需营养素中的任一种时，其皮下组织就会开始成块状的分解，尤其是在头部的软骨组织。起初这些病变并不易察觉，因发病部位的表皮依然完好，直到各个病块被撕裂，白色的软骨组织被分解而成的物质开始渗漏出来。经过一段时间之后，这些分泌物会穿透周围的组织，最后流到伤口外面来。从鱼的外表可发现在头部及眼睛周围出现1—3毫米的蛀洞，看起来就像—条条小白虫由皮肤内钻出来—样。至于大—点的洞，像几毫米直径宽的塞子被顶出来一样，洞孔随时间而扩大。
治疗时除药物控制外，还要注意在食物中有规律地添加足够量的钙、磷和维生素D，穿孔即可愈合。同时在水中添加碳酸钙和硫化镁，可以加速康复的过程及预防患穿孔病。
2．紧迫症
当水体的水温、pH值、硬度等的变化太大时，鱼便会缩成一团，若处理不当，常会因其他病原之混合感染而导致此病。
处理方法应着重于预防，注意水质和水温的变化不要太大。新水加入时注意与旧水慢慢混合，让鱼逐渐适应新水。当鱼病发生时，注意维持水质稳定。若水质不良，要以适宜的水大量更换，必要时使用药物控制病原体感染。
3．碱性病
当水质呈现极端的碱性时，鱼很容易患此病。病征为鱼鳍出现松软无力，唯一的防治方法为经常换水，保持水质洁净和pH值适宜。
4．烫尾病
当养鱼的水过老，绿苔过多时，金鱼常患此病。
其病因主要是，在充足的阳光照射下，饥饿的鱼没有饵料可摄食，被迫摄取绿苔之类的食物。一部分绿苔被鱼摄取而消化，另一部分绿苔碎片到了鱼的鳃器，随着血液循环而输送至鱼的尾鳍之微血管中；在阳光照射下，这些绿苔碎片增生许多细胞，便在尾鳍中形成1个大泡。严重时，使尾鳍血管破裂，或断去部分尾尖；轻者在尾鳍叶上生长许多泡点，鱼的头部朝下，尾鳍朝天，浮在水面。一旦发现这种病鱼，应立即将其移入清水中，次日便可恢复正常。
平时注意养鱼的水不能很长时间不换，尤其是夏季气温很高，绿苔生长很快，要勤换水。投喂饵料的时间应适当提早，上午九时以前喂完，数量要适宜，使鱼不吃其他食物。
