一般而言夏天应是最不易发生疾病的时期。因为这时期的水温比细菌、寄生虫或病毒的繁殖适温要来得高，而且与春天或梅雨期比起来水温也较不易有急剧的变化。但即使如此也不可掉以轻心。因为夏天水温高，锦鲤的活动力增加，饲料也吃得多，容易造成水的污染，这便是造成氧气缺乏的原因，要多加注意。
侵蚀锦鲤的病原菌
在这里就来谈谈细菌吧。所谓的细菌是只有百分之一厘米大左右的单细胞生物，存在于地球的各处。当然在我们体内也有细菌存活着，其中最具代表性的应属大肠菌了。基本上细菌也属生物的一种，因此也就需要依饲食以进行增殖。
细菌的饲料虽会依其种类而有所不同，但其“饲料”却具有重要的意义。也就是说细菌可分为好菌如具有水净化功能的过滤菌等，及对我们人体有害的病菌，而其分别即是依细菌所食的饲料不同与其生活形态不同而来的。如过滤菌的饲料即是水中的阿摩尼亚，它们利用水中的氧气使阿摩尼亚酸化成亚硝酸或硝酸进行再利用所生成的热能来进行生存。
而造成鱼尾腐烂或穿孔的病菌为何要侵蚀鱼儿呢？这是因为它们在侵蚀鱼儿的同时会释放出强力的蛋白质分解酵素（也就是消化剂）附着于鱼的身上，而鱼体的蛋白质会因这些蛋白质分解酵素而溶解造成鱼体的腐烂，而病菌就进食这些溶解的蛋白质。
鱼和人类都是将蛋白质吸收入体内后，于胃或肠中进行分解，而细菌却是于体外分解后再吸收入体内。这是因为蛋白质的分子过大，细菌无法直接将其吸收入体内之故。另外大部分存于水中的细菌则是食用溶解于水中的有机物（如鱼粪或吃剩的饲料等），它们利用氧气有机物分解成二氧化碳和水分后，再利用所产生的热能进行生存。
水中有着多少的细菌呢？
存于水中的细菌数量是依水中所含的养份，也就是有机物的量而定。例如在有岩鱼出没的澄清河川上游而言，其所含的细菌量大约一毫升只有100个左右，但在被生活用排水所污染的下游处一毫升的细菌含量却可高达10万个以上。污水中细菌存在的愈多，其所消耗的氧气量就愈多，使得水中的溶存氧气量愈少。
当溶存氧气量愈低，不要说是鱼，就连需依赖氧气生存的细菌都将无法存活，此时就会出现厌恶氧气的细菌（厌氧菌）。此类细菌即使没有氧气也可将有机物分解成沼气或恶臭物质等等。这些现象在以往的大都市的排水沟等可以见到。
