这种方法占地少，管理比较方便，可在室内、室外，3 4个箱叠放在一起培养栽种，可人为有效地控制湿度、温度。
(1)培养箱的准备：工厂规范化生产可按长60厘米、宽45厘米、高35厘米制箱，在箱底沿边端钻直径2厘米的圆孔6个，亦可用旧包装箱、竹筐等。
箱栽天麻可用固定菌材窖栽法：在箱的周围衬塑料薄膜，在箱底均匀铺1 2厘米碎石和鹅卵石以利排水，再铺一层3 4厘米的木屑和腐殖质土或沙等培养料，顺箱间放菌材和新材4 5根，用培养料填空菌材一半，按一定距离摆放麻种。大白麻间距4-5厘米，米麻间距约3厘米。
注意将麻种栽在菌索的密集处，箱边摆放时，生长点要向内，麻种和箱壁应保持约3厘米以上距离，上覆培养料9厘米左右，如前再摆放第二层菌材和新材，用培养料填空至菌材一半，栽种第二层麻种后，上覆盖培养料8厘米，再覆2厘米纯锯末封面。
箱栽管理：
①室内越冬和室内箱栽生长期管理。一般在11 12月天麻的箱栽基本完成，可以在室内保管。
室内温、湿度应尽量保持相对稳定，即栽种箱内温度为1 5℃，最好为2 4℃，切忌忽高忽低。
越冬箱培养料的湿度应为35％一45％，切忌过湿，以防冻伤。
第二年2 3月将箱搬入温室，逐渐升温培养，开始10一15℃，使天麻在最佳温度下快速生长。
②室外越冬。双层薄膜透光棚，以日光为能源，采取严密保温措施，能使箱内温度在O℃以卜，这样麻箱在双层薄膜内安全越冬(适于北方和高寒山区使用)。选背风向阳，土层深厚的山坡，挖半地下式棚坑。前墙高0．8一l米，后墙高2米，宽4 5米。平整周边后，按50厘米间距，顺坡搭第一层木方，随后覆单层塑料薄膜，周边埋入土中，再在其上15 20厘米处，搭第二层木方，铺放第二层塑料薄膜，周边用土压紧培严，做好封闭门。为防风保温，可设置防风障；严冬夜间应在棚上覆盖草帘。
③室外箱栽生长期的管理。搭棚设栏。为了避免阳光直射和便于控制温、湿度的变化，搭高2米左右的荫棚，面积大小根据需要而定，上面覆盖用草编成的帘子，使透光度达20％一60％，四周设栏，围上草帘(搭棚设栏)。 在4月中、下旬一般将天麻箱搬出室外荫棚下按行放置，先用砖、石作垫，使箱底离地面10厘米，以利滤水、透气和防霉腐。
控制好温、湿度，天麻和蜜环菌生长的温度为10一28℃，最适宜温度为20 25℃，湿度为45％一60％，必须加强荫蔽、通风、浇水、覆盖等措施。
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