马来西亚巨龟的饲养比较困难，主要的原因在于其巨大的体型，很多人饲养马来巨龟只能选择在水池里饲养，这样一来的话，虽说节约了空间，但是水质与温度就很难控制了。
一、马来西亚巨龟的水质管理
马来西亚巨龟长期生活在水中，水质的好坏直接影响龟的健康，池水透明度低于30厘米时，应及时换水并交替全池泼洒生石灰和漂白粉，以预防疾病的发生。春、秋季水位适中，夏、冬季水位加深，起到降温和保温作用。春、夏、秋季宜在喂食后换水，冬季宜在喂食前换水。
二、马来西亚巨龟的冬季管理
当水温22℃时，在饵料中拌入抗生素类药物，增强其越冬期抗病力。水温14℃时龟已冬眠，这时需对龟进行检查，不健康的龟应加温饲养，保持水温22℃以上，采取相应治疗措施并正常喂食。健康的龟进入冬眠后，每半月换水1次，
水温保持在10℃以上。冬眠中，对一些漂浮水面的龟应及时捞出，隔离加温饲养。随着气温的升高，水温达15℃左右，龟有少量活动。温度18℃时已有少量龟觅食，第1次喂食前需清池、消毒。
