亚马逊泥龟在野生环境下是肉食性的龟，但是在人类饲养的时候，也会接受一些植物性的食物以及龟粮，这是一个比较好的现象，但是在饲养时，为了保证龟不会出现消化不良，要注意喂食的方法。
亚马逊泥龟食性较广，稻谷、小麦、豌豆、小鱼、虾、昆虫、蜗牛等均吃，其中最喜欢吃的食物是小鱼、蜗牛、玉米和稻谷。人工饲养时，为满足亚马逊泥龟生长所需要的各种营养，避免因饲料单一而生长发育不良和产生厌食症，应采用多种饲料，如动物性饲料中的鱼虾、蜗牛、河蚌等和植物性饲料中的稻谷、小麦、玉米等。
要想让亚马逊泥龟充分地消化这些饲料，在投喂饲料之前，须先将玉米、豌豆等压碎，浸泡2小时左右，其他大块食物也须先切碎，然后才投喂。还须注意的是，在亚马逊泥龟生长的不同时期，应根据其生长特点投以含不同营养成分的饲料。亚马逊泥龟的生活与气候关系密切，每年4月初开始摄食；6~8月摄食活动达最高峰，增重速度最快；至10月气温逐渐下降后其来食量开始下降，当气温降到10摄氏度以下时，则停止摄食，进入冬眠期。
