一是由于低毒力猪瘟病毒株的感染。这种低毒力猪瘟病毒主要来自猪瘟强毒，其长期、零散、重复地通过免疫不全的猪体，使毒力逐渐减弱，但仍保持一定的毒力，能使幼龄、免疫不全和免疫空白的猪发生非典型猪瘟。
二是猪瘟疫苗的使用。仔猪体内的母源抗体抑制并中和侵入的猪瘟病毒，使毒力减弱，而引起仔猪非典型猪瘟的发生。
三是由于妊娠母猪在妊娠期间注射猪瘟疫苗。猪瘟疫苗是活疫苗(弱毒)，它能通过母猪的胎盘引起仔猪死胎、木乃伊胎，并导致产后不久非典型猪瘟的发生。因此，妊娠母猪严禁注射猪瘟疫苗。母猪应在配种前(发情前)2周左右注射猪瘟疫苗。有条件的场户最好对仔猪采用超前免疫，即产后2小时不让仔猪吃初乳，肌注猪瘟疫苗1毫升，60～65天用4头份剂量再注射1次。
在猪瘟免疫时，尽量消除母源抗体的干扰带来的不利影响。有条件的猪场可以采用抗体水平监测，一般在猪瘟抗体水平过了最高峰，抗体效价为1：16左右时，进行猪瘟疫苗免疫，免疫的成功率较高。
在购买猪瘟疫苗时，要到经畜牧部门认定的疫苗供销商那里购买正规企业生产的合格产品；
同时，要注意识别生产企业及产品批准文号。不要因贪图便宜而走其他非正规渠道，由于假疫苗内有活毒，注射假疫苗简直等于人工散毒，其产生的严重危害不可估量。
