从立冬到次年春分，这5个月时间为耕牛越冬期。入冬后气温下降，耕牛对饲料中热量等营养成分的需求也随之增加。为保证来年春耕生产，必须重视耕牛的越冬管理。
贮足越冬草料。稻草是目前农区耕牛越冬的主要饲料。以早稻草为好，适口性较好，养分含量较晚稻草高，农药残留较少。一般每头成年黄牛应备越冬草料1700公斤左右，成年水牛为2500公斤。如果有条件，最好能准备一些青贮料。
注意防寒保暖。入冬前要检修栏舍，做到上不漏雨，侧不透风，地不潮湿。冬季雨雪天多，耕牛舍饲时间长，粪尿多，要勤换垫草，保持栏舍干燥，提高栏舍保温性能。
牛冬痢
主要危害犊牛，发病率高。耕牛患病后，身体逐渐消瘦，食欲减退，被毛粗糙、松乱，眼结膜苍白，反刍缓慢，排便里急后重，时常带有新鲜血块。如不及时治疗，呈慢性衰弱继发其他疾病而死亡。
防治：治疗可口服保护剂和收敛剂，用松馏油、克辽林各30--50克混合灌服，或用米糠0.5千克炒黄冲热开水2.5千克灌服，严重的病牛可进行葡萄糖补液。据实践，用以下中药治疗有很好的效果。处方是：白术40克、党参30克、干姜20克、茯苓25克、炙甘草10克、小茴香15克，水煎，待凉灌服，每天2次，连服3天可收到满意效果。
牛肺疫
发病初期只出现短促的干咳。随着病情发展，体温缓慢升高，食量减少，反刍迟缓，咳嗽增多，鼻腔流出黏脓性鼻液。病重时不吃食，体温持续41℃--42℃，胸前皮下水肿，迅速消瘦，最后呼吸困难窒息而死。
防治：不在病区购买耕牛；病区要严格封锁、消毒，对病牛应宰杀处理或隔离治疗。接种牛肺疫弱毒菌苗可预防本病。治疗可用新胂凡钠明（914），按每100千克体重1克计，以生理盐水或蒸馏水10毫升稀释，静脉注射，隔天1次；或注射链霉素，每100千克体重用2.5克--4克，肌肉注射，每天1次，连续用药7天。
