应对大肠杆菌感染应保证足够的空栏时间，做好饲料以及饮水的质量控制，并可用硫酸青霉素、粘杆菌素等配合补充电解质治疗；病毒性腹泻则需充足电解质加上阿司匹林或者肠轻松来修复肠绒毛，并保持栏舍干燥、通风；球虫引起的腹泻可用磺胺五甲、驱虫散解决。
从生理结构上来讲腹泻主要在胃和肠。这一部分也有专家建议，初乳含有大量免疫球蛋白（抗体），即使仔猪要寄养也需在哺乳过初乳（出生后6小时内）之后；肠道可以通过解剖判断是否变薄、损伤，以及是否有脂肪类物来分辨细菌、病毒性腹泻。
“造成腹泻的原因五花八门，一定要搞清楚你的猪是哪种情况，对症下药。”针对当前流行的高死亡率哺乳仔猪腹泻，有业内专家提醒道。可能近几年大家遇到腹泻的情况就下意识地认为是流行性腹泻（PED），其实不然，一般来说零星散发的考虑细菌性或者球虫感染，可以通过药物治疗，爆发式的腹泻则首先考虑病毒性腹泻。球虫引起的腹泻根据感染小肠或大肠，粪便带血呈红色或者黑色；病毒性腹泻主要是流行性腹泻、传染性胃肠炎和轮状病毒，最典型的症状是水样腹泻，并呈绿色，流行性腹泻的粪便用PH试纸测试呈酸性，轮状病毒与大肠杆菌感染的则为碱性。
