因为呼吸道综合征的发病原因是多种病因综合作用的结果，所以此病的免疫预防不能只靠单一的方法，必须采取严密的综合防疫措施，在实际免疫预防操作中可以根据猪场呼吸道综合征的发病情况结合实验室的研究报告进行使用。
1、应用商品疫苗
重点考虑猪瘟、猪肺炎霉形体、猪伪狂犬、猪衣原体、猪胸膜肺炎放线杆菌、链球菌病及猪繁殖和呼吸练合征等病的免疫。
2、应用自家苗
请求正规疫苗的生产单位，采集典型病死猪有明显病变的器官，制成灭活苗注射，在有些猪场应用，已取得较好的效果。
3、使用血清
选老龄健康母猪或病愈猪无菌采血，析出血清后，加入青霉素和链霉素，可供预防和治疗。
4、风土驯化
对新引进的种猪隔离观察1-2月确定无疫病后，混人一、二头本场的淘汰种猪，使其对本场微生物群体适应，产生相应的抗病力。
