在鱼缸的背部或侧部用玻璃隔出一部分做过滤，其内部分成几小格用于放置滤材（或过滤设备）和循环泵，一边设有溢流口，当水泵把水从过滤部分抽向鱼缸时，鱼缸溢出的水通过溢流口流入过滤部分的第一格，在隔板的引导下“从上到下”或“从下到上”流经各种滤材，水从最后一格通过水泵再次送入鱼缸，如此循环。其缺点是挤占了鱼缸空间，影响视觉效果，清洁、更换滤材比较麻烦。
六、滴流式过滤
滴流式过滤是个集成的过滤器，它将物理过滤与生物过滤合在一个过滤槽中，在此过滤槽中分成几个室，过滤槽的上层为物理过滤室，放置有生化棉、生化石和生化磁环，作用是减低水的流速，增加水与空气的接触面，使水能含有最大的容氧量，为好氧性细菌提供最理想的生存环境。这个过滤室主要完成初始的杂质过滤。第二个过滤室为生化过滤室，在其中有许多塑胶制成的生物过滤球，供硝化细菌附着繁殖用。第三个过滤室为活性炭，去除水中的臭味和黄色物质。这种过滤方式能最大限度地将水中的杂质过滤干净。但鱼缸需承受一定重量，所以做多层上滤时一定要考虑鱼缸的承受能力。
七、外置过滤桶
所有的滤材、水泵都藏在一个过滤桶内，在过滤桶内有4～5个过滤盒，每个过滤盒内都有不同的过滤材料，一般首层放置过滤棉，对水质进行初级过滤，将水中的杂质过滤干净，另外几层可以放置瓷环、活性碳等，通过盒内大量的硝化细菌对水中的氨氮、亚硝酸盐进行生化过滤，形成一个物理与生化组合的完整过滤系统。常用来补强成品缸的硝化过滤系统，尤其是较高密度养鱼或鱼对水质的要求高时。
八、生化棉过滤/气举动式生化过滤器
生化棉过滤/气举动式生化过滤器是过滤器中最简单的过滤器，它是通过增氧泵吹气到生化棉以造成水流由生化棉的外部向生化棉的内部流动，同时通过气泵的不断吹气，为硝化细菌提供大量的氧分，在流动中将脏物留在生化棉上，再由水中或生化棉上的硝化菌来分解，形成一个生物过滤的环境。生化棉主要用于饲养超小型的鱼类，如红绿灯、金丝等，因为，超小型鱼类的体型一般较轻，容易被过滤器吸入过滤槽内，生化棉过滤器可以避免这个问题，但是，生化棉过滤器不适应在水。
