这是目前治疗鱼病最常用的方法，可驱除体表寄生虫及治疗细菌性的外部疾病，也可利用鳃或皮肤组织的吸收作用治疗细菌性内部疾病。浸洗治疗法是将病鱼故人药液中浸浴一定的时间后捞出，放回水中的方法。具体方法是，先用面盆等容器，盛入一定量的清水，一次放人所需药量，等药物充分溶解后将药液搅匀，再用温度计测试水温，以确定浸洗时间，然后将病鱼放人药液 中，药液浓度根据不同药物使用说明书。浸洗时间的长短，主要根‘据水温高低和鱼体耐药程度而定。寄生虫病一般浸洗1-2小时即可奏效；传染性鱼病需浸洗多次才能痊愈，重复浸洗要间隔1-2天。注意药液要现用现配。常用药为澳氰菊酯、亚甲基蓝、红药水、敌百虫、高锰酸钾等。
二、全水体施药
又叫药浴治疗法。此法的目的是杀灭鱼体上、水草上和水体中的病原体，从而使病鱼痊愈。方法是采用低浓度的、对鱼体既安全又有明显疗效的药物，均匀地遍洒于水体中，严格计算好用药量，如发现任何不良反应，应立即停止治疗。治疗前病鱼要停喂12-48小时，减少耗氧量，水中溶氧要充足，避免温度波动太大。药浴常用药物有食盐、高锰酸钾、福尔马林、呋喃类抗生素等。必须注意的是无论是浸洗还是药浴，药剂计量必须精确。如浓度不够，则不能有效地杀灭病菌；如果浓度太高，易对锦鲤造成毒害，甚至死亡。
三、内服药饵
此法是将药物拌人病鱼的饵料中投喂，主要防治营养失调及细菌性疾病和内脏器官的病变及体内寄生虫病。常用药品为营养素、呋喃类、磺胺类和抗生素等。首先将药剂溶于水，使之渗遗到粒状饲料中或混合在粉料中揉捏成条后喂给病鲤。但是对已经丧失摄食能力的锦鲤不适用。
四、注射法
通常采用腹腔、胸腔和肌内注射，主要治疗一些传染病。尤其适用于大型锦鲤，这种方式对鱼体吸收药物更为有效、直接。
五、局部处理
也叫手术法，如摘除寄生虫，对外伤和局部炎症涂药等，从而达到治愈锦鲤疾病的目的，如亲鱼产卵后受伤，可用红霉素软膏涂抹生殖腺。涂抹前必须先将患处清理干净后施药，常用药为红药水、碘酊和高锰酸钾等，主要治疗外伤及鱼体表面的疾病。
如病情较严重时常采取多种治疗方法，如同时口服和药浴或注射抗生素。
