提到腐生菌，这里普及一下水产养殖会应用到的微生物，及其作用：
1、光合细菌：这个大家都很熟悉，“产氢、固氮、分解有机物”，可迅速消除氨氮、硫化氢，有机酸等有害物质，改善水体，稳定水质及PH值。
2、硝化细菌：能利用氨和亚硝酸盐为生存能源（这点学术界上有争议，也是在水族业界内展开讨论的，主要是围绕PH值对硝化细菌的影响），能利用CO2作为主要碳源，自养菌，好氧。（其他的大家比我熟悉，在此就不多说了。）
3、芽孢杆菌：属革兰氏阳性菌，好气性细菌。水产养殖经常用到的是枯草芽孢杆菌，能及时降解水体有机物，如鱼类排泄物、残饵、浮游生物残体，有机碎屑等。还有一个特性就是可以减少有机物好氧，间接增加水体溶氧量。
4、酵母菌：属真核生物，在有氧条件下，能将溶解于水中的糖类、有机酸作为其所需的碳源，对糖类的分解，可完全氧化为CO2和水；在缺氧条件下，酵母菌能利用糖类作为碳源进行发酵和繁殖。因此，酵母菌能迅速地分解水中糖类，减少水中生物耗氧量。
5、放线菌：可降解氨氮、增加溶氧量、稳定PH。
6、蛭弧菌：可寄生在某种细菌上并导致其裂解，可迅速裂解鱼虾致病菌，减少鱼病蔓延，同时对氨氮有一定的去除作用，可促进生长，增强免疫力。
对于厌氧菌的运用，主要是完成硝化作用的最后一个环节，将硝酸盐降解。在草缸中有一定积极作用，但本人认为并非必要，可以理解为更高一个级别的配备。
