在泡浸后，极易造成内部营养物质的析出，造成沉木长出白色的泡状或白毛状物。这些主要是水中的真菌引起的水下发霉现象。但总的来说，沉木白毛并不对水中生物的健康有大的影响，相反有些鱼类如金苔鼠等喜欢啄食沉木上的这些白毛状或白泡状发霉物。所以一旦沉木出现白色毛状物或者絮状物，可以采取生物法去除。可以放入金苔鼠等鱼类，也可以使用化学方法，将沉木取出，使用高锰酸钾浸泡，不过使用化学药品还是对水质产生不利影响，因为高锰酸钾也会伤害水中已有的硝化系统。
如果嫌生物法去除太慢的话，也可以考虑放进沸水中消毒，不过过一段时间仍有可能重新长出白毛。有的时候的白毛是黑毛藻现象，与本文的真菌白毛不同，应注意区别。
