在植物占优势的水族箱内，要加装水流循环装置，促使植物形成的氧气完全溶解于水中，让鱼类及菌类都能得到供应，并可保持水质的清澈。而在鱼类占优势的水族箱中，则要加装流通式滤水设备、喷水装置以及渗透（或回转）式装置，一方面可过滤水中过多的排泄物及毒素，一方面则可增加水和空气接触的机会。
五、二氧化碳的需求
如果水中栽培的植物不多，而照明设备微弱，那么水中的二氧化碳倒是不虞匮乏；但若种了太多生长快速的绿色植物或色彩鲜丽的植物，最好定期在水中放置少量的干冰（固态二氧化碳），以防二氧化碳之不足。
六、植物所需之有机肥
在鱼类占优势的水族箱中，含有大量主要的有机矿物性养分，此时植物需要一些稀有微量元素肥料，如铁化物等，以促进其生长。反之，在植物占优势的水族箱中，几乎没有硝酸盐和磷酸盐的存在，因此必须小心施放饵料（切勿过量），以促进鱼类之生长。但是不要使用含氮、磷质的饲料，因为这些成份太强，会杀死水生植物。
七、水族箱中的过滤工程
装置过滤设备有几个好处，其一是它能清除水中污浊的成分，使水质看起来美观清澈；再者它可以防止污泥或细砂粒沉积在植物表面；此外，它还能促进水的持续流动，使鱼类及植物所需的养分，均可充分地散布水中；负责分解排泄物和毒素的细菌，也会寄居在过滤设备上（若无过滤设备，它们极不易在漂动的水中繁随），而不致散布水中，对鱼类产生威胁。
