七彩神仙鱼常见的眼球疾病有：角膜混淆，角膜溃疡，角膜炎，角膜结膜炎，虹膜炎，眼突出，晶状体混淆（白内障）等。造成眼睛疾病的原因，除先天发育不正常外，还有以下几点原因：
1.水质不良：亚硝酸盐升高，氨超标，水太酸等原因。
2.机械性损伤：因捕捞，打斗引起的伤害。
3.病原体引起：例如细菌的感染，或者寄生虫（白点虫，吸虫等）造成的伤害，波及眼睛。
治疗办法：
首先要隔离病鱼，以免被其它鱼咬啄，使伤害更严重。然后停喂饵料，防止水质恶化。针对细菌性的感染，加以药物治疗。采用Flex的七彩神仙专用高效杀菌药粉，海宝的爱斯拉奇等市售药物都可以治疗。
有些七彩神仙鱼好象咽喉梗塞似的；呼吸不顺，在水族箱里紧张的游来游去，怎么办？这种疾病主要是由鳃虫引起。
方法1.用MASOTEN马速展（敌百虫）短时间药浴（剂量0.25ppm），1小时后100%换水，隔日再作1次，需5个疗程可趋除鳃虫。（此方法不多用，因为会影响公鱼的体能。）另一种方法是100mg马速展加100水，鱼浸泡4天后换水。整个过程需一个星期。
方法2：用孔雀石绿与福尔马林综合液（1克孔雀石绿与3500ml 福尔马林混合成综合溶液）治疗。用2.5ppm综合液长期药浴2天后100%换水，共5个疗程。
方法3：用上述孔雀石绿与福尔马林综合液200ppm药浴1小时后100%换水，两天后再使用1次，共需使用5次。
方法4：用高锰酸钾3ppm药浴8小时后,100%换水，再用2ppm药浴2天后再100%换水，需连续用3次至5次以上（隔天一次）。
