1、满月即能分辨
一般而言，年幼的孔雀鱼，假若发育的状况是正常的，大约在一个月左右就可以分辨性别了。倘若在一个月时仍然难以辨析，有可能是因为饲料食物或者水质状况不好造成小鱼生长发育过慢。
2、差异一星期内
孔雀鱼儿尚未分辨出公母的状况，可能还受到温度高低、饲料鱼饵质量、鱼儿本身品种或者个体差异的关系所造成，原则上辨别差异在一个星期上下皆属正常。
3、产生颜色顺序
就孔雀鱼来说，通常在幼鱼时，先发出颜色的基本上是性别为雄的孔雀鱼儿，雌鱼发色的速度则较晚一点。
4、观察腹部颜色
同时，也可以观察腹部后方，若是可以看到腹部里边的颜色则为小母鱼，若是看到腹部后方里边是以白肚皮包裹者的，而且看不太到颜色的通常是小公鱼。
二、成年孔雀鱼公母辨别
1、成鱼不同幼鱼
通常来说，孔雀鱼的成鱼辨认的程度很高，不若还是幼鱼时期的那样难分辨。 2、公鱼较为鲜艳
孔雀公鱼的鱼鳍很大，身体色泽也很美，花纹很多；但母鱼则反之，孔雀母鱼的鱼鳍略为短小，身体颜色泽较为单调，没有炫丽的斑纹。假若母鱼的鱼鳍上有花纹，则属品质较好的鱼种。总之，母鱼颜色没有公鱼鲜艳美丽。
3、公鱼尾鳍较大
成年的孔雀公鱼体长约3厘米上下，身体较短，但尾部就占了身体长度约三分之二，甚至更多；公鱼尾巴比较大，母鱼尾巴较小。成年的孔雀母鱼体长约5~6厘米左右，身体较长，尾鳍较短，尾部占了身体长度约超过二分之一。一般来说尾巴皆是黑色的。
4、鱼鳍形状不同
孔雀公鱼的臀鳍是长型棒状，孔雀母鱼则是扇形。孔雀公鱼的腹鳍较为细长，而且鳍尖头位置有个小钩，母鱼则较为宽大而且短样。
5、雄雌腹部特点
孔雀公鱼的特色是腹部较小且瘦长，最重要的是牠的臀齐演化为交接器，用在繁殖时有输送精子功能。故孔雀公鱼的前方几根臀鳍较为粗大，孔雀雌鱼的臀齐则较为一般且均匀。
6、有无胎斑形状
孔雀公鱼因为全身都是美丽的花纹，所以没有胎斑也看不到腹腔部位的内脏，但母鱼身体呈现透明模样，在肛门处如果有出现黑斑，就表示已经怀孕。若胎斑越大越明显，代表离生产时间越接近。
