五味子冬季修剪时期较长，从植株进入休眠后2～3周至第2年伤流开始之前1个月均可以进行修剪。
修剪一般从新梢基部的明显芽眼起剪，留1～2个芽或只留基芽为超短梢修剪，留1～4个芽为短梢修剪，留5～7个芽为中梢修剪，8个芽以上为长梢修剪，15个芽以上称超长梢修剪。
五味子以中长梢修剪为主，根据植株生长情况进行长、中、短梢配合修剪。
修剪时，剪口离芽眼2cm左右，离地面30cm架面内不留枝。在枝蔓未布满架面之前，对主蔓延长枝只剪去未成熟部分；对侧蔓的修剪以中长枝为主，间距为15～20cm，适度疏剪叶丛枝，也可不剪。对上一年剪留的中、长枝要及时回缩；为适当增加留芽量，可剪留结果小组，即在侧枝上同一位置剪留2个或2个以上的结果单位。
上一年的延长枝由于结果过多，应以健壮枝条进行更新。
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