野生环境下的马来果龟通常是植食性的，吃一些肉类食物的几率不是特别大，但是人工饲养环境下，为了保证马来果龟的健康，一些人尝试饲喂肉类，收到一定的效果。
人工饲喂的马来果龟是杂食性的。人们曾经发现它们津津有味地进食蚯蚓、蜗牛、蛞蝓和蟋蟀。除了无脊椎动物以外，还应该供给它们大量品种丰富的色拉，三天一次。色拉应该由切细的罗曼生菜、羽衣甘蓝、南瓜、胡萝卜、甜马铃薯、苹果、香蕉、香瓜、草莓和梨，甚至是芒果和番木瓜，只要买得到——构成，并且选料不必过于精细。除了蚯蚓，香蕉和芒果也被证明，用于让新来马来果龟开食是非常有效的。等它们开始吃东西以后，建议加入一些较为高蛋白的食物，比如浸湿的商业龟粮，把它们拌入色拉，以增加龟的营养摄入。
脱水、压力以及特别大量的寄生虫，都被证明是进口的马来果龟健康问题的构成部分。有很多马来果龟会发生拒食，进口的个体死亡率也非常之高。
