沼泽箱龟的健康状况与饮食是分不开的，提供给他相应的食物很重要，野生环境下沼泽箱龟会捕捉一些昆虫等小动物，所以在人类饲养时也要提供给其一定的肉类食物，为了保证营养的均衡，也要提供蔬菜与水果。
沼泽箱龟可以挖掘地下的蚯蚓或枯木中的虫类，蜗牛，毛虫，甲虫等为主食，也会吃果实，青草，浆果类，菌类及野花等植物类食物，主要是在陆地上觅食。而在人工环境下，要长期成功的饲养箱龟，就需要花较多时间去注意它们的进食状况，并经常调整食物的内容。以达到营养均衡的要求。基本上箱龟食物中，动物性蛋白质如面包虫，蟋蟀或蚯蚓等要占50%，也可以用箱龟饲料替代。
植物类的食物如一般蔬菜类，豆类，萝卜和马铃薯等可占箱龟食物的30%。至于青草，苜蓿，稻草，萝卜叶等纤维质较高的植物可占10%。多种食物的组合可以帮助箱龟保持均衡的营养和消化道通畅。另外的10%就由葡萄，苹果奇异果，草莓和樱桃等水果组成。除了日常食物外，维它命和钙粉必须每周至少供应一次，可以与食物混合喂食，且一定得定期晒太阳或照含有UVB紫线的爬虫灯，否则钙质是无法吸收的。
