就是说生物在形成生殖细胞时，成对的因子彼此分离，分别进人不同的生殖细胞中。他用纯种圆滑豌豆进行杂交，发现杂交后的子一代（Fl ）结的都是圆滑的豌豆，而皱褶这一性状似乎消失了。然后把Fl 自行授粉，产生子二代（凡）o 几结的豌豆，多数是圆滑的，但也有少数是皱褶的，两者的比例大致是3 : 1 。
对这些现象，孟德尔作了以下的解释。① 每个生殖细胞内部都有控制性状发育的因子（基因），它是遗传性状的决定者。② 在体细胞中，这些因子成对存在。③ 在生殖细胞成熟的过程中，成对的因子分离，各进人一个生殖细胞中，结果每个生殖细胞只是成对因子中的一个。④ 到了受精的时候，精子与卵子结合为一，精子与卵子各自带有一个因子，两个因子合在一起，因此因子又恢复到两个或一对。孟德尔进一步假定，在一起的成对的两个因子，可以是相同的，也可以是不相同的，相同的称为纯合子，不相同的称为杂合子。这对因子往往可以分为显性与隐性两种。显性因子不论是纯合子或杂合子总能表现出来，隐性因子就不是这样，在纯合子的情况下，它能表现出来，因为没有其他因子的影响；在杂合子的情况下，它不能表现出来，它的作用为显性因子所覆盖。例如，圆滑与皱褶这一对因子，圆滑的是显性因子，皱褶的是隐性因子。
对鸽子来说，红色鸽子的因子就像圆滑的豌豆一样是显性的，而黑色、灰色以及这两种羽色混杂的雨点鸽子，都和皱褶的豌豆一样是隐性的。当红色的鸽子与其他羽色鸽子相遇时，红色的显性因子将会掩盖其他羽色的隐性因子，从而表现在红色的子代身上。为了便于理解，不妨以生物学常用的代号来分析。雄鸽体细胞的性染色体组合为XX ，现在假设XR 代表具有红色因子的X 性染色体，而以XX 来代表具有其他羽色因子而不具有红色因子的性染色体。如果这羽雄鸽具有纯合子的红色因子，则可表示为XRXR ；如果这羽雄鸽是具有杂合子的红色因子，则可表示为XRXr 。具有XRXR 之雄鸽所产生的精子只有XR 一种性染色体，如果与一羽不是红色的雌鸽配种，它们所生的后代，将由于R 因子对其他羽色决定因子的显性作用，子鸽不论雌雄都表现出红色。而当以XRxr 雄鸽与非红色的雌鸽（Xry ）配种时，它们后代的羽色将有所不同。由于这种配对，雄鸽的精子可有xr 及XR 两种形式，而雌鸽的卵子有Xr 及y 两种，所以它们后代的羽色可能有如下4 种：
XRXr 相遇：出红色雄鸽，但它的羽色控制因子组合为杂合子。
XRr 相遇：出红色雌鸽。
XrXr 相遇：出雨点、灰或黑色的雄鸽。
Xry 相遇：出雨点、灰或黑色的雌鸽。如果把一羽灰色雄鸽与一羽红色的雌鸽配对，它们的后代表现是十分有趣的。一羽灰色雄鸽的代号XrXr ，它的精子的形式只有Xr 一种，而红色雌鸽的代号是XRy ，所以它的卵子有xR 及y 两种。因此，它们后代的组合方式只有两种：xrxR 相遇出红色雄鸽，Xry 相遇出红色雌鸽。有些鸽友认为，一羽红鸽的羽毛杂有黑色的斑点是杂合子，没有黑色斑点是纯合子，这不完全正确。要区分一羽红色雄鸽是否是纯合子，只要看它的后裔，如果只出红色鸽子就是纯合子，否则就是杂合子。这里必须指出的是，出花雌鸽或红雌鸽时，它们的羽毛上也会有斑点出现，但这些斑点是淡棕色的，而不是黑色的
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