1、配制营养土 营养土和营养钵主要用于蔬菜、花卉和特种作物的育苗，因此，对营养条件要求高，自然土壤往往难以满足，而沼渣营养全面，可以广泛生产，完全满足营养条件要求。用沼渣配制营养土和营养钵，应采用腐熟度好、质地细腻的沼渣，其用量占混合物总量的20%—30%，再掺入50%—60% 泥土、5%—10%的锯末、0.1%—0.2%的氮、磷、钾化肥及微量元素、农药等拌匀即可。如果要压制成营养钵等，则配料时要调节黏土、砂土、锯末的比例，使其具有适当的黏结性，以便于压制成形。
2、做基肥 一般做底肥每 667米 2施用量为2000千克，可直接泼洒田面，立即耕翻，以利沼肥入土，提高肥效。我县2009—2011年在蓝溪镇沈田村的晚稻生产试验中得出：每 667米 2增施沼肥1500—2000千克（含干物质450—600千克），当年可使水稻平均增产11%左右；每 667米 2施沼肥2000—2500千克，可增产15%—25%，连续施用二年以上，土壤有机质可增加0.2%—0.8%，活土层从30厘米增加到40厘米。
3、做追肥 每 667米 2用量1500—2000千克，可以直接开沟挖穴浇灌作物根部周围，并覆土以提高肥效。我县去年在临城镇龙翔村进行沼渣肥不同使用方法在玉米生产上的试验结果为：沼渣肥密封保存施用比对照增产8.5%—12%，晾晒施用比对照增产8.0%—10%，沼液直接开沟覆土施用或沼液拌土密封施用均比对照增产6.0%—7.0%，而沼液拌土晾晒施用比对照增产4.0%—5.0%。有水利条件的地方也可结合农田灌溉，把沼渣、沼液加入水中，随水均匀施入田间。
4、沼渣与碳酸氢铵堆沤 沼肥内含有一定量的腐殖酸，可与碳酸氢铵发生化学反应，生成腐殖酸铵，增加腐殖质的活性，提高肥效。当沼渣的含水量下降到60%左右时，可堆成 1米 左右的堆，用木棍在堆上扎无数个小孔，然后按每100千克沼渣加碳酸氢铵4— 5千克 ，拌和均匀，收堆后用稀泥封湖，再用塑料薄膜盖严，充分堆沤5—7天，做底肥，每 667米 2用量250—500千克，也可做苗期追肥。
5、沼渣与过磷酸钙堆沤 每100千克含水量50%—70%的湿沼渣，与 5千克 过磷酸钙拌和均匀，堆沤腐熟7天，能提高磷素活性，起到明显的增产效果。一般做基肥每 667米 2用量500—1000千克，可增产粮食13%以上，增产蔬菜15%以上。