一、多数生物农药无内吸性，喷药时要留意喷洒均匀能力起到良好效果。如白僵菌，必须将菌体均匀喷洒到害虫身上，菌体不断滋生，最终使害虫代谢错乱而死亡。
二、生物农药作用迟缓，宜在害虫低龄幼虫期使用。许多生物农药杀虫效果迟缓，比不上化学农药，喷后立杆见影。因此，用药时间应比化学农药提早2—5天。如BT乳剂、白僵菌等，通常喷药后，害虫3—5天才逐步死亡。
三、要留意喷药的气候条件。生物农药有些菌类，只有适宜的气候条件，这类农药才会充分发挥作用。通常生物农药适宜的温度为20—30℃，湿度越大越好，同时要避免过强的光照条件，杀死有益菌。
四、使用时要随配随用，配好的农药一次用完，如白僵菌，配好的农药要在2小时内喷完，免得孢子过早萌发，失去效劳。
五、生物农药能够和多种杀虫剂混用，或加入少量洗衣粉，能增长其粘着能力，提高药效。
六、生物农药不能和杀菌剂混用，生物农药多为菌类，和杀菌剂混杂后，它主要成份菌类也被杀死，农药也就失去了效果。
七、生物农药不能与碱性农药混用，农药中的微生物大都生活在酸性环境条件下，与碱性农药混用，就损坏了这些微生物的生存环境，引起菌类失活，农药的失效。
八、留意贮藏：生物农药贮藏的地点恳求阴凉、单调、避免受潮失效。如苏云金秆菌、井岗霉素等，它们的特点是不耐高温、不耐贮藏，容易吸湿霉变，失活失效，而且保留期不能超过2年。