1、电石、各种剧毒农药、刚喷洒了农药的农作物茎叶、刚消过毒的禽畜（鸡兔等）粪便、肥皂水、洗衣粉水都不能进入沼气池，以防沼气池里的甲烷菌受破坏。如发生这种情况，应将池内发酵料液全部清除，并用清水将沼气池冲洗干净，然后再重新加料。老虎花、号桐、马料（土名）等作物的茎叶、花不能入池，有红汞、碘酒的棉球、纱布等也不能入池。
2、禁止把各种枯饼、骨粉、棉籽饼和磷矿粉（磷肥）投入沼气池，以防产生对人体有重要危害剧毒气体——磷化三氢。
3、沼气池要勤进料，保持池内有充足的新鲜发酵原料，勤出料，保证沼气池有足够的贮气空间。进、出料要基本保持平衡。
二、安全管理
1、沼气池的进、出料口要加盖，防止人畜掉进池内造成伤亡。
2、要经常观察压力表的变化，当池子产气旺盛，池内压力过大时，要立即用气或放气，以防顶开天窗口盖和压力表。
3、加料入沼气池，如数量较大，应打开开关，慢慢地加入。一次出料较多，压力表的水柱下降到接近“0”时，应打开开关，以免产生负压，损害池子。
4、沼气池一旦进料后，不要轻易下池出料或检修，如需下池，不能在出料后立即下池，一定要做好安全防护措施。一是要使进出料口通风，使新鲜空气充分换入；二是把小动物放入池内观察15-30分钟，动物能正常活动方可下池；三是下池人员仍须系安全绳，且池外有人看守，不能一人单独作业，下池人员稍感不适，应立即到池外休息。
5、不得在池口周围点火照明或吸烟，进池人员只能用手电筒或镜子反光照明，严禁使用明火。
6、禁止向池内丢明火烧余气，防止失火、烧伤或引起池子爆炸。
三、安全用气
沼气是易燃气体，燃点比较低（550℃），遇火即会猛烈燃烧，使用时必须十分注意，使用过程中防止火灾和烧伤事故。
1、使用沼气时要先点燃引火物，后扭开关，先开小点，待点燃后才全部打开，以防一时沼气放出过多，烧到身体或引起火灾。使用结束后应拧紧开关。
2、沼气灯、炉具及输气管不应靠近柴草、易燃、易爆品，以防漏气失火，一旦发生火灾，应立即切断气源。
3、禁止在沼气池导气管口点火，导气管口点火易引起回火，造成池内燃烧，发生爆炸，炸坏池子和伤害人、畜。点火试气应用3米以上长度输气管将沼气引到炉具上试验。
4、在使用沼气的过程中，要经常注意输气系统及其它配件是否破损、漏气、堵塞。如在室内闻到臭皮蛋气味，应迅速打开门窗，将沼气排出室外，此时千万不要用火柴、油灯、蜡烛、打火机等明火，以防引起火灾，当臭皮蛋气味完全消失后，才能使用明火。
四 、安全出料和维修
1、沼气池正常使用3至5年取渣出料一次，将池内粪液抽干，揭开天窗敞口三天后，用风扇不间断往池内鼓风，将有害气体排出，然后先用小动物放入池内，观察15分钟左右，如无异常，方可入池取渣。
2、禁止入池人员在池内使用马灯、油灯、蜡烛、火柴、打火机等明火和吸烟，只能用电灯、电筒等无明火照明入池操作。
3、沼气池使用数年后，出现漏水漏气时，将池内料液出完，用清水将全池冲洗干净后检查裂缝部位，把裂缝部分打掉，剔成V形，用1：1的水泥沙浆粉糊分2—3次补平、压实，然后全池刷浆3—5次。