1.电石，各种剧毒农药、刚喷撒了农药的作物茎刚消过毒的禽畜（鸡兔等）粪便、肥皂水、洗衣粉水都不能进入沼气池，以防沼气池里的沼气细菌受破坏。如发生这种情况，应将池内发酵料液全部清除，并用清水将沼气池冲洗干净，然后再重新加料。
    2.不是所有的植物都可以作为沼气发酵原料。例如：桃叶、百部、马钱子果、皮皂皮、元江金不菊、元江黄芩、大蒜、葱、辣椒、韭菜、萝卜、植物生物碱、地衣酸金属化合物、盐类等。
    3.禁止把各种枯饼、骨粉、棉子饼和磷矿粉（磷肥）投入沼气池以防产生对人体有严重危害的剧毒体——磷化三氢。
    4.沼气池要勤进料，保持池内有充足的新鲜发酵原料，勤出料，保证沼气池有足够的贮气。